Het onderzoek van Daniël Boer richt zich op de fysica van elementaire deeltjes, in het bijzonder op quarks en gluonen (QCD) en op mogelijke nieuwe deeltjes voorbij het Standaard Model van elementaire deeltjesfysica. In 2019 werd Boer verkozen tot fellow van de American Physical Society voor "contributions toward the understanding of the spin and momentum structure of quarks and gluons in nucleons, in particular those relevant in single spin asymmetries, and for studies of the color glass condensate phase in quantum chromodynamics.” Dat werk heeft mede het programma van de toekomstige Electron-Ion Collider (EIC) vormgegeven. De EIC wordt gebouwd in de V.S. en zal rond 2030 in gebruik worden genomen. Vooral de synergieën tussen de EIC en de LHC zijn momenteel vormen zijn huidige onderzoeksinteresse. Dit gaat met name over nieuwe effecten bij hoge energieën t.g.v. het collectieve gedrag van gluonen en de theoretische beschrijving daarvan.

De kennis van gluonen is essentieel voor de correcte beschrijving van hoog-energetische botsingen. Dit geldt ook voor de zoektocht naar nieuwe deeltjes. Tot dusver zijn er geen experimentele indicaties voor zulke nieuwe fysica, daarom moeten theoretische onderzoekingen algemene principes volgen. Het blijkt echter heel moeilijk om zeer symmetrische theorieën te vinden die natuurlijk zijn, d.w.z. die zonder fine-tuning reduceren tot het Standaard Model bij lage energieën en die de extreem stringente experimentele metingen respecteren. Dat is probleem dat al lang bestaat en waarschijnlijk een compleet nieuwe aanpak vereist, wat ook een onderzoeksinteresse vormt.  

Daniël Boer received his education in theoretical physics at Utrecht University (1989-1994), did his PhD research at Nikhef, Amsterdam (1994-1998) and received his PhD degree at the VU University Amsterdam in September 1998. He became a postdoctoral research associate at the RIKEN-BNL Research Center (RBRC), Brookhaven National Laboratory (BNL), Long Island, New York, U.S.A. (1998-2001). He returned to the Netherlands on a fellowship of the Royal Netherlands Academy of Arts and Sciences (KNAW) at the VU University Amsterdam, where he became lecturer and obtained tenure in 2005. In 2009 he moved to the University of Groningen (first to KVI and later to VSI) to become a full professor in 2017. In 2019 he was elected Fellow of the American Physical Society. He is best known for the Boer-Mulders function (published in 1998 in Physical Review D with his PhD thesis advisor Piet Mulders). He is currently scientific director of the Van Swinderen Institute for Particle Physics and Gravity (VSI) of the Faculty of Science and Engineering. He is and has been member of various committees and boards, both nationally and internationally, such as the SPSC & PBC of CERN, and he was elected European Representative of the Electron-Ion Collider User Group (2017-2021).