Dianne Jansen

2025

Genome-wide meta-analysis associates donor-recipient non-HLA genetic mismatch with acute cellular rejection post-liver transplantation

TransplantLines Investigators, Nieuwenhuis, L. M., Li, Y., Loza, B.-L., Lambeck, A. J. A., Hu, S., Gacesa, R., Voskuil, M. D., Hepkema, B. G., Jansen, B. H., Blokzijl, H., Verkade, H.-J., van den Heuvel, M. C., Asrani, S., Testa, G., Klintmalm, G., Trotter, J., Olthoff, K. M., Shaked, A. & Keating, B. J. & 3 anderen, Weersma, R. K., Festen, E. A. M. & de Meijer, V. E., jan.-2025, In: Hepatology communications. 9, 1, 15 blz., e0601.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

32 Downloads (Pure)

2024

Choice of DNA extraction method affects stool microbiome recovery and subsequent phenotypic association analyses

Fernández-Pato, A., Sinha, T., Gacesa, R., Andreu-Sánchez, S., Gois, M. F. B., Gelderloos-Arends, J., Jansen, D. B. H., Kruk, M., Jaeger, M., Joosten, L. A. B., Netea, M. G., Weersma, R. K., Wijmenga, C., Harmsen, H. J. M., Fu, J., Zhernakova, A. & Kurilshikov, A., 16-feb.-2024, In: Scientific Reports. 14, 11 blz., 3911.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

12 Citaten (Scopus)

122 Downloads (Pure)

Limited predictive value of the gut microbiome and metabolome for response to biological therapy in inflammatory bowel disease

Prins, F. M., Hidding, I. J., Klaassen, M. A. Y., Collij, V., Schultheiss, J. P. D., Uniken Venema, W. T. C., Bangma, A., Aardema, J. B., Jansen, B. H., Mares, W. G. N., Witteman, B. J. M., Festen, E. A. M., Dijkstra, G., Visschedijk, M. C., Fidder, H. H., Vich Vila, A., Oldenburg, B., Gacesa, R. & Weersma, R. K., 2024, In: Gut Microbes. 16, 1, 18 blz., 2391505.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

2 Citaten (Scopus)

59 Downloads (Pure)

Mucosal host-microbe interactions associate with clinical phenotypes in inflammatory bowel disease

Hu, S., Bourgonje, A. R., Gacesa, R., Jansen, B. H., Björk, J. R., Bangma, A., Hidding, I. J., van Dullemen, H. M., Visschedijk, M. C., Faber, K. N., Dijkstra, G., Harmsen, H. J. M., Festen, E. A. M., Vich Vila, A., Spekhorst, L. M. & Weersma, R. K., 17-feb.-2024, In: Nature Communications. 15, 14 blz., 1470.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

23 Citaten (Scopus)

101 Downloads (Pure)

The gut microbiome across the cardiovascular risk spectrum

Prins, F. M., Collij, V., Groot, H. E., Björk, J. R., Swarte, J. C., Andreu-Sánchez, S., Jansen, B. H., Fu, J., Harmsen, H. J. M., Zhernakova, A., Lipsic, E., van der Harst, P., Weersma, R. K. & Gacesa, R., jun.-2024, In: European Journal of Preventive Cardiology. 31, 8, blz. 935–944 26 blz.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

13 Citaten (Scopus)

89 Downloads (Pure)

The gut microbiome in end-stage lung disease and lung transplantation

TransplantLines Investigators, Zhang, S., Swarte, J. C., Gacesa, R., Knobbe, T. J., Kremer, D., Jansen, B. H., de Borst, M. H., Harmsen, H. J. M., Erasmus, M. E., Verschuuren, E. A. M., Bakker, S. J. L., Gan, C. T., Weersma, R. K. & Björk, J. R., jun.-2024, In: Msystems. 9, 6, 15 blz., e0131223.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

2 Citaten (Scopus)

89 Downloads (Pure)

2023

Faecal metabolome and its determinants in inflammatory bowel disease

Vich Vila, A., Hu, S., Andreu-Sánchez, S., Collij, V., Jansen, B. H., Augustijn, H. E., Bolte, L. A., Ruigrok, R. A. A. A., Abu-Ali, G., Giallourakis, C., Schneider, J., Parkinson, J., Al-Garawi, A., Zhernakova, A., Gacesa, R., Fu, J. & Weersma, R. K., aug.-2023, In: Gut. 72, 8, blz. 1472-1485 14 blz.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

77 Citaten (Scopus)

194 Downloads (Pure)

Health-related quality of life is linked to the gut microbiome in kidney transplant recipients

TransplantLines Investigators, Swarte, J. C., Knobbe, T. J., Björk, J. R., Gacesa, R., Nieuwenhuis, L. M., Zhang, S., Vila, A. V., Kremer, D., Douwes, R. M., Post, A., Quint, E. E., Pol, R. A., Jansen, B. H., Londen, M. V., Borst, M. D., Meijer, V. E. D., Blokzijl, H., Berger, S. & Festen, E. A. M. & 5 anderen, Zhernakova, A., Fu, J., Harmsen, H. J. M., Bakker, S. & Weersma, R. K., 2-dec.-2023, In: Nature Communications. 14, 1, 11 blz., 7968.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

12 Citaten (Scopus)

139 Downloads (Pure)

Health-Related Quality of Life is Linked to the Gut Microbiome in Kidney Transplant Recipients

Swarte, J., Knobbe, T., Björk, J., Gacesa, R., Nieuwenhuis, L., Zhang, S., Vich Vila, A., Kremer, D., Douwes, R., Post, A., Quint, E., Pol, R., Jansen, B., de Borst, M., de Meijer, V., Blokzijl, H., Berger, S., Festen, E., Zhernakova, A. & Fu, J. & 3 anderen, Harmsen, H., Weersma, R. & Bakker, S., feb.-2023, Research Square Company.

Onderzoeksoutput: Voordruk › Academic

Bestand

96 Downloads (Pure)

Unsuitability of the Oxidation-Reduction Potential Measurement for the Quantification of Fecal Redox Status in Inflammatory Bowel Disease

Geertsema, S., Jansen, B. H., van Goor, H., Dijkstra, G., Faber, K. N. & Bourgonje, A. R., 21-nov.-2023, In: Biomedicines. 11, 12, 11 blz., 3107.

Onderzoeksoutput › Academic › peer review

Open Access

Bestand

1 Citaat (Scopus)

82 Downloads (Pure)

2022

Environmental factors shaping the gut microbiome in a Dutch population

Gacesa, R., Kurilshikov, A., Vich Vila, A., Sinha, T., Klaassen, M. A. Y., Bolte, L. A., Andreu-Sánchez, S., Chen, L., Collij, V., Hu, S., Dekens, J. A. M., Lenters, V. C., Björk, J. R., Swarte, J. C., Swertz, M. A., Jansen, B. H., Gelderloos-Arends, J., Jankipersadsing, S., Hofker, M. & Vermeulen, R. C. H. & 6 anderen, Sanna, S., Harmsen, H. J. M., Wijmenga, C., Fu, J., Zhernakova, A. & Weersma, R. K., 2022, In: Nature. blz. 732–739 25 blz.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

422 Citaten (Scopus)

3329 Downloads (Pure)

Gut microbiome dysbiosis is associated with increased mortality after solid organ transplantation

Swarte, J. C., Li, Y., Hu, S., Björk, J. R., Gacesa, R., Vich Vila, A., Douwes, R. M., Collij, V., Kurilshikov, A., Post, A., Klaassen, M. A. Y., Eisenga, M. F., Gomes-Neto, A. W., Kremer, D., Jansen, B. H., Knobbe, T. J., Berger, S. P., Sanders, J.-S. F., Heiner-Fokkema, M. R. & Porte, R. J. & 10 anderen, Cuperus, F. J. C., de Meijer, V. E., Wijmenga, C., Festen, E. A. M., Zhernakova, A., Fu, J., Harmsen, H. J. M., Blokzijl, H., Bakker, S. J. L. & Weersma, R. K., 31-aug.-2022, In: Science Translational Medicine. 14, 660, 15 blz., eabn7566.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

54 Citaten (Scopus)

615 Downloads (Pure)

HIF1α-Dependent Induction of TFRC by a Combination of Intestinal Inflammation and Systemic Iron Deficiency in Inflammatory Bowel Disease

Fagundes, R. R., Bourgonje, A. R., Hu, S., Barbieri, R., Jansen, B. H., Sinnema, N., Blokzijl, T., Taylor, C. T., Weersma, R. K., Faber, K. N. & Dijkstra, G., 8-jun.-2022, In: Frontiers in Physiology. 13, 16 blz., 889091.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

10 Citaten (Scopus)

111 Downloads (Pure)

Mucosal host–microbe interactions associate with clinical phenotypes in inflammatory bowel disease

Hu, S., Bourgonje, A. R., Gacesa, R., Jansen, B. H., Björk, J. R., Bangma, A., Hidding, I. J., van Dullemen, H. M., Visschedijk, M. C., Faber, K. N., Dijkstra, G., Harmsen, H. J. M., Festen, E. A. M., Vila, A. V., Spekhorst, L. M. & Weersma, R. K., 4-jun.-2022, BioRxiv.

Onderzoeksoutput: Voordruk › Academic

Open Access

Mucosal microbiota modulate host intestinal immune signatures in Inflammatory Bowel Disease

Hu, S., Bourgonje, A. R., Gacesa, R., Jansen, B. H., Bangma, A., Hidding, I., Festen, E. A. M., van Dullemen, H. M., Visschedijk, M. C., Dijkstra, G., Harmsen, H. J. M., Vich Vila, A., Spekhorst, L. M. & Weersma, R. K., 21-jan.-2022, In: Journal of Crohn's and Colitis. 16, Suppl(1), blz. S185-S186 2 blz.

Onderzoeksoutput › Academic

Open Access

Bestand

54 Downloads (Pure)

2021

Donor genetic variants as risk factors for thrombosis after liver transplantation: A genome-wide association study

Li, Y., Nieuwenhuis, L. M., Voskuil, M. D., Gacesa, R., Hu, S., Jansen, B. H., Uniken Venema, W. T., Hepkema, B. G., Blokzijl, H., Verkade, H. J., Lisman, T., Weersma, R. K., Porte, R. J., Festen, E. A. M. & de Meijer, V. E., sep.-2021, In: American Journal of Transplantation. 21, 9, blz. 3133-3147 15 blz.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

6 Citaten (Scopus)

113 Downloads (Pure)

Exome sequencing in patient-parent trios suggests new candidate genes for early-onset primary sclerosing cholangitis

Haisma, S.-M., Weersma, R. K., Joosse, M. E., de Koning, B. A., de Meij, T., Koot, B. G., Wolters, V., Norbruis, O., Daly, M. J., Stevens, C., Xavier, R. J., Koskela, J., Rivas, M. A., Visschedijk, M. C., Verkade, H. J., Barbieri, R., Jansen, D. B., Festen, E. A., van Rheenen, P. F. & van Diemen, C. C., 11-mrt.-2021, In: Liver International. 14 blz.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

8 Citaten (Scopus)

146 Downloads (Pure)

Genetic risk scores identify genetic aetiology of inflammatory bowel disease phenotypes

Parelsnoer Institute and the Dutch Initiative on Crohn and Colitis, Voskuil, M. D., Spekhorst, L. M., van der Sloot, K. W. J., Jansen, B. H., Dijkstra, G., van der Woude, C. J., Hoentjen, F., Pierik, M. J., van der Meulen, A. E., de Boer, N. K. H., Löwenberg, M., Oldenbrug, B., Festen, E. A. M. & Weersma, R. K., jun.-2021, In: Journal of Crohn's and Colitis. 15, 6, blz. 930-937 8 blz.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

7 Citaten (Scopus)

91 Downloads (Pure)

Inflammation status modulates the effect of host genetic variation on intestinal gene expression in inflammatory bowel disease

Hu, S., Uniken Venema, W. T., Westra, H.-J., Vich Vila, A., Barbieri, R., Voskuil, M. D., Blokzijl, T., Jansen, B. H., Li, Y., Daly, M. J., Xavier, R. J., Dijkstra, G., Festen, E. A. & Weersma, R. K., 18-feb.-2021, In: Nature Communications. 12, 1, 10 blz., 1122.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

29 Citaten (Scopus)

109 Downloads (Pure)

The composition and metabolic potential of the human small intestinal microbiota within the context of inflammatory bowel disease

Ruigrok, R. A. A. A., Collij, V., Sureda, P., Klaassen, M. A. Y., Bolte, L. A., Jansen, B. H., Voskuil, M. D., Fu, J., Wijmenga, C., Zhernakova, A., Weersma, R. K. & Vich Vila, A., aug.-2021, In: Journal of Crohn's and Colitis. 15, 8, blz. 1326-1338 13 blz.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

26 Citaten (Scopus)

117 Downloads (Pure)

2020

Pirfenidone Inhibits Cell Proliferation and Collagen I Production of Primary Human Intestinal Fibroblasts

Cui, Y., Zhang, M., Leng, C., Blokzijl, T., Jansen, B. H., Dijkstra, G. & Faber, K. N., 22-mrt.-2020, In: Cells. 9, 3, 16 blz., 775.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

44 Citaten (Scopus)

114 Downloads (Pure)

Riboflavin Supplementation in Patients with Crohn's Disease [the RISE-UP study]

von Martels, J. Z. H., Bourgonje, A. R., Klaassen, M. A. Y., Alkhalifah, H. A. A., Sadaghian Sadabad, M., Vich Vila, A., Gacesa, R., Gabriëls, R. Y., Steinert, R. E., Jansen, B. H., Bulthuis, M. L. C., van Dullemen, H. M., Visschedijk, M. C., Festen, E. A. M., Weersma, R. K., de Vos, P., van Goor, H., Faber, K. N., Harmsen, H. J. M. & Dijkstra, G., mei-2020, In: Journal of Crohn's and Colitis. 14, 5, blz. 595-607 13 blz.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

83 Citaten (Scopus)

191 Downloads (Pure)

Systemic iron deficiency and intestinal inflammation control gut mucosal HIF-1α and TFRC activation in inflammatory bowel disease

Bourgonje, A. R., Fagundes Rosa, R. R., Hu, S., Barbieri, R., Jansen, B. H., Blokzijl, T., Taylor, C. T., Faber, K. N. & Dijkstra, G., 11-okt.-2020, In: United European Gastroenterology Journal. 8, 8(Suppl), blz. 9-10 2 blz., OP004.

Onderzoeksoutput: Meeting Abstract › Academic

2019

A combined set of four serum inflammatory biomarkers reliably predicts endoscopic disease activity in inflammatory bowel disease

Bourgonje, A. R., von Martels, J. Z. H., Gabriëls, R. Y., Blokzijl, T., Buist-Homan, M., Heegsma, J., Jansen, B. H., van Dullemen, H. M., Festen, E. A. M., Visschedijk, M. C., Weersma, R. K., de Vos, P., Faber, K. N. & Dijkstra, G., 25-jan.-2019, In: Journal of Crohn's and Colitis. 13, 1

Onderzoeksoutput › Academic

A Combined Set of Four Serum Inflammatory Biomarkers Reliably Predicts Endoscopic Disease Activity in Inflammatory Bowel Disease

Bourgonje, A. R., von Martels, J. Z. H., Gabriëls, R. Y., Blokzijl, T., Buist-Homan, M., Heegsma, J., Jansen, B. H., Dullemen, van, H. M., Festen, E. A. M., ter Steege, R. W. F., Visschedijk, M. C., Weersma, R. K., de Vos, P., Faber, K. N. & Dijkstra, G., 5-nov.-2019, In: Frontiers in Medicine. 6, blz. 251 13 blz., 251.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

49 Citaten (Scopus)

184 Downloads (Pure)

A Combined Set of Four Serum Inflammatory Biomarkers Reliably Predicts Endoscopic Disease Activity in Inflammatory Bowel Disease

Bourgonje, A. R., Gabriëls, R. Y., von Martels, J. Z. H., Blokzijl, T., Buist-Homan, M., Heegsma, J., Jansen, B. H., van Dullemen, H. M., Festen, E. A. M., Visschedijk, M. C., Weersma, R. K., de Vos, P., Faber, K. N. & Dijkstra, G., mei-2019, In: Gastroenterology. 156, 6, blz. S848 1 blz., Mo1814.

Onderzoeksoutput › Academic

Combining absolute quantification of fecal bacteria with metagenomic sequencing data improves the characterization of the gut microbiome of patients with Crohn’s disease

Vich Vila, A., Boddeke, A., Kurilshikov, A., Collij, V., Sureda Horrach, P., Martels ,von, J. Z. H., Bourgonje, A. R., Klaassen, M. A. Y., Hu, S., Jansen, D., Faber, K. N., Dijkstra, G., Zhernakova, S., Harmsen, H. J. M. & Weersma, R. K., okt.-2019, In: United European Gastroenterology Journal.

Onderzoeksoutput › Academic

Novel clinical and genetic risk factors for early post-operative thrombosis in liver transplantation

Li, Y., Nieuwenhuis, L., Voskuil, M., Gacesa, R., Hu, S., Jansen, B., Werner, M., Blokzijl, H., Hepkema, B., Lisman, T., Weersma, R., Porte, R., Festen, E. & deMeijer, V., 2019, In: Transplant International.

Onderzoeksoutput › Academic

Riboflavin suppresses inflammation and attenuates Crohn’s disease symptoms (RISE-UP Study)

von Martels, J. Z. H., Bourgonje, A. R., Klaassen, M. A. Y., Alkhalifah, H. A. A., Sadaghian Sadabad, M., Vich Vila, A., Gacesa, R., Gabriels, R. Y., Steinert, R. E., Jansen, B. H., Bulthuis, M. L. C., van Dullemen, H. M., Visschedijk, M. C., Festen, E. A. M., Weersma, R. K., de Vos, P., van Goor, H., Faber, K. N., Harmsen, H. J. M. & Dijkstra, G., okt.-2019, In: United European Gastroenterology Journal. 7, 8(Suppl), blz. 460-461 2 blz., P0683.

Onderzoeksoutput › Academic

Single-Cell RNA Sequencing of Blood and Ileal T Cells From Patients With Crohn's Disease Reveals Tissue-Specific Characteristics and Drug Targets

Uniken Venema, W. T., Voskuil, M. D., Vich Vila, A., van der Vries, G., Jansen, B. H., Jabri, B., Faber, K. N., Dijkstra, G., Xavier, R. J., Wijmenga, C., Graham, D. B., Weersma, R. K. & Festen, E. A., feb.-2019, In: Gastroenterology. 156, 3, blz. 812-+ 26 blz.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

45 Citaten (Scopus)

679 Downloads (Pure)

Systemic iron deficiency is associated with activation of the HIF-1α pathway in the intestinal mucosa of patients with Inflammatory Bowel Disease

Fagundes Rosa, R. R., Bourgonje, A. R., Barbieri, R., Jansen, D., Taylor, C. T., Faber, K. N. & Dijkstra, G., okt.-2019, In: United European Gastroenterology Journal.

Onderzoeksoutput: Meeting Abstract › Academic

WHOLE-EXOME SEQUENCING IN EARLY-ONSET PRIMARY SCLEROSING CHOLANGITIS: FIRST RESULTS OF THE WHELP-STUDY

Haisma, S.-M., Weersma, R. K., Joosse, M. E., De Koning, B., de Meij, T., Koot, B., Wolters, V., Norbruis, O. F., Daly, M. J., Stevens, C., Xavier, R., Rivas, M. A., Visschedijk, M. C., Verkade, H. J., Barbieri, R., Jansen, D., Festen, E. A., van Rheenen, P. & van Diemen, C. C., mei-2019, In: Gastroenterology. 156, 6, blz. S1187 1 blz.

Onderzoeksoutput › Academic

2018

Genomic and Expression Analyses Identify a Disease-Modifying Variant for Fibrostenotic Crohn's Disease

Visschedijk, M. C., Spekhorst, L. M., Cheng, S.-C., van Loo, E. S., Jansen, B. H. D., Blokzijl, T., Kil, H., de Jong, D. J., Pierik, M., Maljaars, J. P. W. J., van der Woude, C. J., van Bodegraven, A. A., Oldenburg, B., Löwenberg, M., Nieuwenhuijs, V. B., Imhann, F., van Sommeren, S., Alberts, R., Xavier, R. J. & Dijkstra, G. & 4 anderen, Faber, K. N., Aldaz, C. M., Weersma, R. K. & Festen, E. A. M., mei-2018, In: Journal of Crohn's and Colitis. 12, 5, blz. 582-588 7 blz.

Onderzoeksoutput: Article › Academic › peer review

Open Access

Bestand

17 Citaten (Scopus)

75 Downloads (Pure)

Dianne Jansen

Onderzoeksoutput

Zoekresultaten